二次购房税的计算方法如下：
普通住宅：如果购买的是家庭第二套住房，契税按照成交价的3%计算缴纳，成交价格不含增值税。
非普通住宅：无论面积和套数，商业用房的契税都是成交价的3%。
特殊政策：
如果新房价格大于拆迁补偿款，按照差额缴契税；如果拆迁补偿价格大于网签价格，免征契税（差额部分可以继续使用）。
对于90平方米及以下的普通住房，如果该住房属于家庭唯一住房，契税可以减按1%征收；如果该住房不是家庭唯一住房，契税按照3%征收。
卖方缴纳：持有满2年的普通住宅免征增值税，持有满2年的非普通住宅按交易差额乘以5.6%征收增值税。
卖方缴纳：如果持有满5年且是家庭唯一住房，免征个人所得税；否则，按交易差额的20%征收个人所得税。
买方缴纳：个人取得不动产权证按5元/件缴纳印花税。
买方缴纳：购房款的2%-3%，具体比例根据当地政策而定。
建议
咨询当地税务部门：由于不同地区的税务政策可能存在差异，建议在计算二次购房税前，先咨询当地税务部门或通过其提供的在线工具进行确认。
准备相关材料：在计算税额时，需要准备好房屋的交易价格、面积、持有年限等相关材料，以便准确计算应缴税款。