昆山违建的处理方式通常遵循以下步骤和原则：
政府执法机关在发现违建事实或接到举报后，进行立案并调查。
执法人员收集相关证据，包括询问记录、建筑物信息、工程许可资料等，以确定建筑是否为违章建筑。
根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法规，违建的处理可能包括：
罚款：对尚可采取改正措施消除影响的违建，可处以建设工程造价5%至10%的罚款。
限期拆除：对无法采取改正措施消除影响的违建，限期拆除，不能拆除的，可没收实物或违法收入。
停工：对正在建设的违建，责令停止建设。
吊销资质：对机关事业单位或生产经营单位违法建设，可吊销相关证照。
责令违建业主在规定期限内自行拆除或改正。
若业主逾期不拆除或改正，政府可组织强制拆除，并可能依法追究相关责任人的责任。
违建当事人享有复议和诉讼的权利。
在法定期限内不复议、不诉讼又不拆除的，行政机关可依法作出强制执行公告，并强制拆除违建。
以上步骤和原则根据最新的法律法规和实际操作流程总结而来。需要注意的是，具体处理方式可能会因案件具体情况而有所不同。