税务稽查方式主要分为以下几种：
税务局在发现企业存在疑点时，可能会先约企业过去进行沟通，了解相关情况。
税务局有时会要求企业进行自查，以确认是否存在税务问题。
如果自查未能发现问题，税务局可能会派人到企业进行实地检查。
发现企业存在问题后，税务局可能会对其进行罚款等处罚措施。
如果涉及犯罪行为，税务局可能会将案件移交给司法机关处理。
常规检查是对所有与进出口活动直接相关的企业和单位进行的全面性检查，而专项检查则针对风险程度较高或政策敏感性较强的企业或行业进行。
验证稽查是企业稽查人员针对需稽查验证的企业，通过准入式或监控式稽查，验证其守法状况或贸易安全情况。
税务部门通过随机抽取企业或个人某一期间的税务记录，分析实际运营情况与记录信息是否一致，并进行核查。
税务稽查部门会直接选定某些企业或个人进行税务稽查，重点关注经营期限较长或税收偷逃风险较大的经济实体。
税务部门利用外部信息进行精细化选择，推进税务稽查工作。
利用数据库技术、数据仓库技术等，将多个行政部门的数据资源集成为一个多维度的数据库，进行税收风险分析和核查。
包括检查账簿、原始凭证等，以核实企业的纳税情况。
税务部门与企业负责人或相关人员沟通，了解具体情况，收集证据。
查阅企业的财务报表、会计凭证等，核实纳税情况。